Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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