Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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