Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms