Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nicn1Q9CQM0 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms