Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9CQC3 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9CQC3 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9CQC3 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9CQC3 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9CQC3 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9CQC3 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9CQC3 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9CQC3 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9CQC3 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9CQC3 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9CQC3 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9CQC3 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms