Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Use1Q9CQ56 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Use1Q9CQ56 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Use1Q9CQ56 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Use1Q9CQ56 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Use1Q9CQ56 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Use1Q9CQ56 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Use1Q9CQ56 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Use1Q9CQ56 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Use1Q9CQ56 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Use1Q9CQ56 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Use1Q9CQ56 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Use1Q9CQ56 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Use1Q9CQ56 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Use1Q9CQ56 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Use1Q9CQ56 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Use1Q9CQ56 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Use1Q9CQ56 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Use1Q9CQ56 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Use1Q9CQ56 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Use1Q9CQ56 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Use1Q9CQ56 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Use1Q9CQ56 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Use1Q9CQ56 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Use1Q9CQ56 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Use1Q9CQ56 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Use1Q9CQ56 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Use1Q9CQ56 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Use1Q9CQ56 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms