Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prpf8Q99PV0 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms