Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms