Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB8

Ubqln4, Ubiquilin-4, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln4Q99NB8 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubqln4Q99NB8 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubqln4Q99NB8 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubqln4Q99NB8 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubqln4Q99NB8 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubqln4Q99NB8 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubqln4Q99NB8 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubqln4Q99NB8 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubqln4Q99NB8 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubqln4Q99NB8 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ubqln4Q99NB8 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubqln4Q99NB8 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubqln4Q99NB8 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubqln4Q99NB8 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubqln4Q99NB8 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubqln4Q99NB8 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubqln4Q99NB8 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubqln4Q99NB8 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubqln4Q99NB8 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubqln4Q99NB8 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubqln4Q99NB8 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Ubqln4Q99NB8 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubqln4Q99NB8 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubqln4Q99NB8 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubqln4Q99NB8 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubqln4Q99NB8 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubqln4Q99NB8 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubqln4Q99NB8 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubqln4Q99NB8 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubqln4Q99NB8 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubqln4Q99NB8 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubqln4Q99NB8 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubqln4Q99NB8 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubqln4Q99NB8 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubqln4Q99NB8 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Ubqln4Q99NB8 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubqln4Q99NB8 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubqln4Q99NB8 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubqln4Q99NB8 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubqln4Q99NB8 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubqln4Q99NB8 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubqln4Q99NB8 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubqln4Q99NB8 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubqln4Q99NB8 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ubqln4Q99NB8 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ubqln4Q99NB8 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubqln4Q99NB8 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ubqln4Q99NB8 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubqln4Q99NB8 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubqln4Q99NB8 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ubqln4Q99NB8 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ubqln4Q99NB8 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubqln4Q99NB8 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubqln4Q99NB8 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubqln4Q99NB8 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubqln4Q99NB8 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubqln4Q99NB8 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubqln4Q99NB8 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubqln4Q99NB8 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubqln4Q99NB8 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubqln4Q99NB8 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubqln4Q99NB8 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubqln4Q99NB8 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubqln4Q99NB8 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubqln4Q99NB8 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubqln4Q99NB8 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubqln4Q99NB8 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubqln4Q99NB8 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubqln4Q99NB8 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubqln4Q99NB8 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubqln4Q99NB8 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubqln4Q99NB8 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubqln4Q99NB8 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubqln4Q99NB8 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubqln4Q99NB8 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubqln4Q99NB8 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubqln4Q99NB8 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubqln4Q99NB8 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubqln4Q99NB8 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubqln4Q99NB8 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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