Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SrrtQ99MR6 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms