Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nlgn1Q99K10 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nlgn1Q99K10 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nlgn1Q99K10 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Nlgn1Q99K10 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nlgn1Q99K10 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Nlgn1Q99K10 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nlgn1Q99K10 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nlgn1Q99K10 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nlgn1Q99K10 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nlgn1Q99K10 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlgn1Q99K10 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlgn1Q99K10 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlgn1Q99K10 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlgn1Q99K10 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlgn1Q99K10 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlgn1Q99K10 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlgn1Q99K10 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlgn1Q99K10 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlgn1Q99K10 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlgn1Q99K10 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlgn1Q99K10 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlgn1Q99K10 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlgn1Q99K10 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlgn1Q99K10 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlgn1Q99K10 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlgn1Q99K10 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlgn1Q99K10 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlgn1Q99K10 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlgn1Q99K10 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlgn1Q99K10 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlgn1Q99K10 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlgn1Q99K10 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlgn1Q99K10 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlgn1Q99K10 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlgn1Q99K10 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlgn1Q99K10 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlgn1Q99K10 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlgn1Q99K10 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlgn1Q99K10 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlgn1Q99K10 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlgn1Q99K10 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlgn1Q99K10 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlgn1Q99K10 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlgn1Q99K10 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlgn1Q99K10 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nlgn1Q99K10 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nlgn1Q99K10 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nlgn1Q99K10 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nlgn1Q99K10 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nlgn1Q99K10 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nlgn1Q99K10 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nlgn1Q99K10 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nlgn1Q99K10 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nlgn1Q99K10 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nlgn1Q99K10 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nlgn1Q99K10 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nlgn1Q99K10 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nlgn1Q99K10 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nlgn1Q99K10 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nlgn1Q99K10 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nlgn1Q99K10 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nlgn1Q99K10 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nlgn1Q99K10 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nlgn1Q99K10 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Nlgn1Q99K10 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nlgn1Q99K10 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nlgn1Q99K10 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nlgn1Q99K10 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nlgn1Q99K10 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nlgn1Q99K10 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nlgn1Q99K10 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nlgn1Q99K10 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nlgn1Q99K10 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nlgn1Q99K10 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nlgn1Q99K10 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nlgn1Q99K10 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nlgn1Q99K10 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nlgn1Q99K10 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nlgn1Q99K10 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Nlgn1Q99K10 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nlgn1Q99K10 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nlgn1Q99K10 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Nlgn1Q99K10 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nlgn1Q99K10 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nlgn1Q99K10 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nlgn1Q99K10 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nlgn1Q99K10 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nlgn1Q99K10 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nlgn1Q99K10 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nlgn1Q99K10 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nlgn1Q99K10 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nlgn1Q99K10 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nlgn1Q99K10 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nlgn1Q99K10 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nlgn1Q99K10 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nlgn1Q99K10 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nlgn1Q99K10 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nlgn1Q99K10 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nlgn1Q99K10 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms