Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn16Q925N4 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
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