Protein–RNA interactions for Protein: Q923A2

Spdl1, Protein Spindly, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdl1Q923A2 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spdl1Q923A2 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Spdl1Q923A2 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Spdl1Q923A2 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Spdl1Q923A2 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Spdl1Q923A2 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Spdl1Q923A2 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spdl1Q923A2 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spdl1Q923A2 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spdl1Q923A2 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spdl1Q923A2 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spdl1Q923A2 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spdl1Q923A2 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spdl1Q923A2 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spdl1Q923A2 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spdl1Q923A2 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spdl1Q923A2 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spdl1Q923A2 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spdl1Q923A2 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spdl1Q923A2 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms