Protein–RNA interactions for Protein: Q922R1

UPF0183 protein C16orf70 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q922R1 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q922R1 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q922R1 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q922R1 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q922R1 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q922R1 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q922R1 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q922R1 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q922R1 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q922R1 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q922R1 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q922R1 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q922R1 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q922R1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q922R1 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q922R1 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q922R1 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q922R1 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q922R1 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q922R1 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q922R1 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q922R1 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q922R1 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q922R1 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q922R1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q922R1 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q922R1 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q922R1 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q922R1 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q922R1 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q922R1 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q922R1 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q922R1 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q922R1 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q922R1 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q922R1 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q922R1 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q922R1 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q922R1 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q922R1 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q922R1 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q922R1 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q922R1 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q922R1 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q922R1 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q922R1 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q922R1 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q922R1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q922R1 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q922R1 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q922R1 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q922R1 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q922R1 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q922R1 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q922R1 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q922R1 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q922R1 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q922R1 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Q922R1 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q922R1 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q922R1 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q922R1 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q922R1 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q922R1 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q922R1 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q922R1 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q922R1 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Q922R1 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q922R1 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q922R1 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q922R1 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q922R1 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q922R1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q922R1 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q922R1 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q922R1 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q922R1 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q922R1 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q922R1 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q922R1 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q922R1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q922R1 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q922R1 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q922R1 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q922R1 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q922R1 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q922R1 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q922R1 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q922R1 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q922R1 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q922R1 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Q922R1 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q922R1 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q922R1 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Q922R1 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q922R1 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q922R1 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q922R1 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q922R1 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q922R1 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms