Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms