Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klc3Q91W40 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms