Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr995-201ENSMUST00000099924 1113 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm42478-201ENSMUST00000199252 1467 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm44845-201ENSMUST00000208773 335 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 AC132384.10-201ENSMUST00000217862 1204 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Vmn1r35-201ENSMUST00000071414 891 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm28979-201ENSMUST00000190949 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13658-201ENSMUST00000135329 929 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43787-201ENSMUST00000197792 1037 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 CT010480.1-201ENSMUST00000223612 363 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Esp18-201ENSMUST00000179848 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm16617-201ENSMUST00000181008 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm27216-202ENSMUST00000184100 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 1700022E09Rik-202ENSMUST00000188342 387 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm6681-201ENSMUST00000205215 607 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 AC154441.1-201ENSMUST00000223653 1006 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Acbd7-202ENSMUST00000228935 534 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 AC154186.1-201ENSMUST00000227711 1597 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Cep41-210ENSMUST00000169422 438 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37215-201ENSMUST00000194927 1259 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms