Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS4

Rprd1a, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1aQ8VDS4 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Rprd1aQ8VDS4 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Rprd1aQ8VDS4 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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