Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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