Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE4

Uncharacterized protein C9orf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VCE4 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q8VCE4 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q8VCE4 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8VCE4 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8VCE4 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8VCE4 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8VCE4 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8VCE4 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q8VCE4 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8VCE4 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8VCE4 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8VCE4 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8VCE4 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q8VCE4 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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