Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW5

Bbx, HMG box transcription factor BBX, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BbxQ8VBW5 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms