Protein–RNA interactions for Protein: Q8R368

Dnaaf4, Dynein assembly factor 4, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf4Q8R368 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnaaf4Q8R368 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms