Protein–RNA interactions for Protein: Q8R332

Nup58, Nucleoporin p58/p45, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup58Q8R332 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Nup58Q8R332 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup58Q8R332 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms