Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sf3b4Q8QZY9 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sf3b4Q8QZY9 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sf3b4Q8QZY9 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Sf3b4Q8QZY9 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Sf3b4Q8QZY9 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sf3b4Q8QZY9 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Sf3b4Q8QZY9 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sf3b4Q8QZY9 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sf3b4Q8QZY9 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sf3b4Q8QZY9 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sf3b4Q8QZY9 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sf3b4Q8QZY9 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sf3b4Q8QZY9 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms