Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Trappc12Q8K2L8 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Trappc12Q8K2L8 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc12Q8K2L8 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Trappc12Q8K2L8 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc12Q8K2L8 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc12Q8K2L8 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc12Q8K2L8 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc12Q8K2L8 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Trappc12Q8K2L8 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Trappc12Q8K2L8 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc12Q8K2L8 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc12Q8K2L8 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc12Q8K2L8 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc12Q8K2L8 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc12Q8K2L8 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc12Q8K2L8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc12Q8K2L8 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc12Q8K2L8 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc12Q8K2L8 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc12Q8K2L8 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc12Q8K2L8 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc12Q8K2L8 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc12Q8K2L8 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc12Q8K2L8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc12Q8K2L8 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc12Q8K2L8 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc12Q8K2L8 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc12Q8K2L8 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc12Q8K2L8 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc12Q8K2L8 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms