Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2H2

Otud6b, OTU domain-containing protein 6B, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6bQ8K2H2 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud6bQ8K2H2 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud6bQ8K2H2 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud6bQ8K2H2 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud6bQ8K2H2 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud6bQ8K2H2 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud6bQ8K2H2 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud6bQ8K2H2 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud6bQ8K2H2 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud6bQ8K2H2 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud6bQ8K2H2 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud6bQ8K2H2 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud6bQ8K2H2 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud6bQ8K2H2 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud6bQ8K2H2 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud6bQ8K2H2 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud6bQ8K2H2 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud6bQ8K2H2 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud6bQ8K2H2 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud6bQ8K2H2 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud6bQ8K2H2 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud6bQ8K2H2 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud6bQ8K2H2 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud6bQ8K2H2 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud6bQ8K2H2 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud6bQ8K2H2 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud6bQ8K2H2 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud6bQ8K2H2 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud6bQ8K2H2 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud6bQ8K2H2 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud6bQ8K2H2 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud6bQ8K2H2 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud6bQ8K2H2 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud6bQ8K2H2 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otud6bQ8K2H2 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otud6bQ8K2H2 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otud6bQ8K2H2 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otud6bQ8K2H2 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otud6bQ8K2H2 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Otud6bQ8K2H2 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otud6bQ8K2H2 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otud6bQ8K2H2 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otud6bQ8K2H2 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otud6bQ8K2H2 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otud6bQ8K2H2 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otud6bQ8K2H2 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otud6bQ8K2H2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Otud6bQ8K2H2 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otud6bQ8K2H2 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otud6bQ8K2H2 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otud6bQ8K2H2 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otud6bQ8K2H2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otud6bQ8K2H2 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otud6bQ8K2H2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otud6bQ8K2H2 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otud6bQ8K2H2 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Otud6bQ8K2H2 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud6bQ8K2H2 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms