Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Abcf3Q8K268 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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