Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnka2ipQ8CH19 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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