Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms