Protein–RNA interactions for Protein: Q8CF98

Colec10, Collectin-10, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec10Q8CF98 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Colec10Q8CF98 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms