Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDW1

Fam228a, Protein FAM228A, mousemouse

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam228aQ8CDW1 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Fam228aQ8CDW1 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Fam228aQ8CDW1 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms