Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB62

Cntrob, Centrobin, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntrobQ8CB62 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CntrobQ8CB62 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CntrobQ8CB62 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CntrobQ8CB62 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CntrobQ8CB62 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CntrobQ8CB62 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CntrobQ8CB62 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CntrobQ8CB62 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CntrobQ8CB62 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CntrobQ8CB62 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CntrobQ8CB62 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CntrobQ8CB62 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CntrobQ8CB62 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CntrobQ8CB62 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CntrobQ8CB62 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CntrobQ8CB62 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CntrobQ8CB62 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CntrobQ8CB62 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CntrobQ8CB62 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CntrobQ8CB62 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CntrobQ8CB62 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CntrobQ8CB62 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CntrobQ8CB62 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CntrobQ8CB62 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CntrobQ8CB62 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CntrobQ8CB62 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CntrobQ8CB62 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CntrobQ8CB62 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CntrobQ8CB62 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CntrobQ8CB62 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CntrobQ8CB62 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CntrobQ8CB62 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CntrobQ8CB62 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CntrobQ8CB62 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CntrobQ8CB62 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CntrobQ8CB62 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CntrobQ8CB62 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CntrobQ8CB62 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CntrobQ8CB62 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CntrobQ8CB62 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CntrobQ8CB62 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CntrobQ8CB62 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CntrobQ8CB62 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CntrobQ8CB62 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CntrobQ8CB62 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CntrobQ8CB62 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CntrobQ8CB62 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CntrobQ8CB62 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CntrobQ8CB62 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CntrobQ8CB62 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms