Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4U3

Sfrp1, Secreted frizzled-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp1Q8C4U3 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sfrp1Q8C4U3 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sfrp1Q8C4U3 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sfrp1Q8C4U3 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sfrp1Q8C4U3 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sfrp1Q8C4U3 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sfrp1Q8C4U3 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sfrp1Q8C4U3 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sfrp1Q8C4U3 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sfrp1Q8C4U3 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sfrp1Q8C4U3 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sfrp1Q8C4U3 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sfrp1Q8C4U3 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sfrp1Q8C4U3 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sfrp1Q8C4U3 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sfrp1Q8C4U3 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sfrp1Q8C4U3 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sfrp1Q8C4U3 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sfrp1Q8C4U3 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sfrp1Q8C4U3 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sfrp1Q8C4U3 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sfrp1Q8C4U3 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sfrp1Q8C4U3 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sfrp1Q8C4U3 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sfrp1Q8C4U3 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sfrp1Q8C4U3 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sfrp1Q8C4U3 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sfrp1Q8C4U3 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sfrp1Q8C4U3 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sfrp1Q8C4U3 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sfrp1Q8C4U3 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sfrp1Q8C4U3 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sfrp1Q8C4U3 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sfrp1Q8C4U3 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sfrp1Q8C4U3 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sfrp1Q8C4U3 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sfrp1Q8C4U3 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sfrp1Q8C4U3 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sfrp1Q8C4U3 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sfrp1Q8C4U3 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sfrp1Q8C4U3 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sfrp1Q8C4U3 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sfrp1Q8C4U3 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sfrp1Q8C4U3 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sfrp1Q8C4U3 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sfrp1Q8C4U3 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sfrp1Q8C4U3 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sfrp1Q8C4U3 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sfrp1Q8C4U3 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sfrp1Q8C4U3 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sfrp1Q8C4U3 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sfrp1Q8C4U3 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sfrp1Q8C4U3 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sfrp1Q8C4U3 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sfrp1Q8C4U3 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sfrp1Q8C4U3 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Sfrp1Q8C4U3 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sfrp1Q8C4U3 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sfrp1Q8C4U3 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sfrp1Q8C4U3 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sfrp1Q8C4U3 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sfrp1Q8C4U3 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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Sfrp1Q8C4U3 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Sfrp1Q8C4U3 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sfrp1Q8C4U3 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Sfrp1Q8C4U3 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sfrp1Q8C4U3 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sfrp1Q8C4U3 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sfrp1Q8C4U3 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sfrp1Q8C4U3 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sfrp1Q8C4U3 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sfrp1Q8C4U3 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sfrp1Q8C4U3 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sfrp1Q8C4U3 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sfrp1Q8C4U3 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sfrp1Q8C4U3 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sfrp1Q8C4U3 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sfrp1Q8C4U3 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sfrp1Q8C4U3 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sfrp1Q8C4U3 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sfrp1Q8C4U3 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sfrp1Q8C4U3 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sfrp1Q8C4U3 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sfrp1Q8C4U3 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sfrp1Q8C4U3 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sfrp1Q8C4U3 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sfrp1Q8C4U3 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sfrp1Q8C4U3 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sfrp1Q8C4U3 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sfrp1Q8C4U3 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sfrp1Q8C4U3 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sfrp1Q8C4U3 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sfrp1Q8C4U3 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sfrp1Q8C4U3 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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