Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1C8

Pnma1, Paraneoplastic antigen Ma1 homolog, mousemouse

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma1Q8C1C8 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Pnma1Q8C1C8 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnma1Q8C1C8 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnma1Q8C1C8 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnma1Q8C1C8 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnma1Q8C1C8 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnma1Q8C1C8 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnma1Q8C1C8 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnma1Q8C1C8 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnma1Q8C1C8 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnma1Q8C1C8 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnma1Q8C1C8 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnma1Q8C1C8 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnma1Q8C1C8 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnma1Q8C1C8 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Pnma1Q8C1C8 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnma1Q8C1C8 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnma1Q8C1C8 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Pnma1Q8C1C8 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
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Pnma1Q8C1C8 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnma1Q8C1C8 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnma1Q8C1C8 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnma1Q8C1C8 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnma1Q8C1C8 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnma1Q8C1C8 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnma1Q8C1C8 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnma1Q8C1C8 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Pnma1Q8C1C8 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pnma1Q8C1C8 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pnma1Q8C1C8 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Pnma1Q8C1C8 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pnma1Q8C1C8 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pnma1Q8C1C8 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Pnma1Q8C1C8 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pnma1Q8C1C8 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Pnma1Q8C1C8 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pnma1Q8C1C8 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pnma1Q8C1C8 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Pnma1Q8C1C8 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pnma1Q8C1C8 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pnma1Q8C1C8 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pnma1Q8C1C8 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pnma1Q8C1C8 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Pnma1Q8C1C8 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Pnma1Q8C1C8 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pnma1Q8C1C8 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pnma1Q8C1C8 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pnma1Q8C1C8 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pnma1Q8C1C8 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pnma1Q8C1C8 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pnma1Q8C1C8 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pnma1Q8C1C8 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pnma1Q8C1C8 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pnma1Q8C1C8 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pnma1Q8C1C8 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pnma1Q8C1C8 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pnma1Q8C1C8 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pnma1Q8C1C8 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pnma1Q8C1C8 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pnma1Q8C1C8 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pnma1Q8C1C8 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pnma1Q8C1C8 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pnma1Q8C1C8 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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