Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0L9

Gpcpd1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpcpd1Q8C0L9 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpcpd1Q8C0L9 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpcpd1Q8C0L9 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpcpd1Q8C0L9 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpcpd1Q8C0L9 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpcpd1Q8C0L9 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpcpd1Q8C0L9 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpcpd1Q8C0L9 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpcpd1Q8C0L9 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpcpd1Q8C0L9 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpcpd1Q8C0L9 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpcpd1Q8C0L9 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpcpd1Q8C0L9 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpcpd1Q8C0L9 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpcpd1Q8C0L9 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpcpd1Q8C0L9 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpcpd1Q8C0L9 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpcpd1Q8C0L9 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpcpd1Q8C0L9 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpcpd1Q8C0L9 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpcpd1Q8C0L9 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpcpd1Q8C0L9 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpcpd1Q8C0L9 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpcpd1Q8C0L9 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpcpd1Q8C0L9 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpcpd1Q8C0L9 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpcpd1Q8C0L9 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpcpd1Q8C0L9 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpcpd1Q8C0L9 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpcpd1Q8C0L9 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpcpd1Q8C0L9 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpcpd1Q8C0L9 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpcpd1Q8C0L9 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpcpd1Q8C0L9 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpcpd1Q8C0L9 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpcpd1Q8C0L9 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpcpd1Q8C0L9 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpcpd1Q8C0L9 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpcpd1Q8C0L9 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpcpd1Q8C0L9 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpcpd1Q8C0L9 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpcpd1Q8C0L9 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpcpd1Q8C0L9 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpcpd1Q8C0L9 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpcpd1Q8C0L9 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpcpd1Q8C0L9 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpcpd1Q8C0L9 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpcpd1Q8C0L9 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpcpd1Q8C0L9 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpcpd1Q8C0L9 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpcpd1Q8C0L9 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpcpd1Q8C0L9 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpcpd1Q8C0L9 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpcpd1Q8C0L9 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpcpd1Q8C0L9 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpcpd1Q8C0L9 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpcpd1Q8C0L9 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpcpd1Q8C0L9 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpcpd1Q8C0L9 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpcpd1Q8C0L9 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpcpd1Q8C0L9 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpcpd1Q8C0L9 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpcpd1Q8C0L9 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpcpd1Q8C0L9 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpcpd1Q8C0L9 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpcpd1Q8C0L9 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpcpd1Q8C0L9 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpcpd1Q8C0L9 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpcpd1Q8C0L9 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpcpd1Q8C0L9 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpcpd1Q8C0L9 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpcpd1Q8C0L9 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpcpd1Q8C0L9 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpcpd1Q8C0L9 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpcpd1Q8C0L9 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpcpd1Q8C0L9 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpcpd1Q8C0L9 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpcpd1Q8C0L9 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpcpd1Q8C0L9 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpcpd1Q8C0L9 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpcpd1Q8C0L9 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpcpd1Q8C0L9 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpcpd1Q8C0L9 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpcpd1Q8C0L9 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gpcpd1Q8C0L9 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gpcpd1Q8C0L9 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gpcpd1Q8C0L9 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gpcpd1Q8C0L9 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gpcpd1Q8C0L9 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gpcpd1Q8C0L9 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gpcpd1Q8C0L9 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gpcpd1Q8C0L9 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gpcpd1Q8C0L9 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpcpd1Q8C0L9 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpcpd1Q8C0L9 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpcpd1Q8C0L9 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpcpd1Q8C0L9 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpcpd1Q8C0L9 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpcpd1Q8C0L9 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpcpd1Q8C0L9 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms