Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Vmn1r232-201ENSMUST00000077001 1159 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Olfr823-201ENSMUST00000081469 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Gm15394-201ENSMUST00000119656 1308 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Gm10375-201ENSMUST00000100692 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Gm12748-201ENSMUST00000120763 504 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Gm7609-203ENSMUST00000160058 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Gm45579-201ENSMUST00000209367 887 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 mt-Nd4-201ENSMUST00000082414 1378 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Gm16284-201ENSMUST00000140995 400 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Gm14950-201ENSMUST00000149500 1155 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Vmn2r-ps118-201ENSMUST00000176785 908 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Gm26595-201ENSMUST00000181585 484 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
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Trim35Q8C006 Gm18547-201ENSMUST00000192439 811 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
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Trim35Q8C006 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
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Trim35Q8C006 Gm40383-201ENSMUST00000222601 610 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Gm29151-201ENSMUST00000196669 2513 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Gm8177-201ENSMUST00000181591 1336 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 1110059G10Rik-202ENSMUST00000118422 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Gm25843-201ENSMUST00000122582 314 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Gm15104-201ENSMUST00000132626 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Gm16617-201ENSMUST00000181008 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Gm43507-201ENSMUST00000196411 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 9530003J23Rik-201ENSMUST00000020392 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim35Q8C006 Gm8952-201ENSMUST00000206828 1102 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms