Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL9

Iffo1, Intermediate filament family orphan 1, mousemouse

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Length 562 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iffo1Q8BXL9 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Iffo1Q8BXL9 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Iffo1Q8BXL9 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Iffo1Q8BXL9 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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