Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Ube3dQ8BX13 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Ube3dQ8BX13 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Ube3dQ8BX13 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Ube3dQ8BX13 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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