Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TtpaQ8BWP5 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TtpaQ8BWP5 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
TtpaQ8BWP5 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
TtpaQ8BWP5 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.08□□□□□ -0.15
TtpaQ8BWP5 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
TtpaQ8BWP5 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
TtpaQ8BWP5 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
TtpaQ8BWP5 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
TtpaQ8BWP5 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TtpaQ8BWP5 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms