Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
Pggt1bQ8BUY9 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
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Pggt1bQ8BUY9 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
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