Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUM9

Usp43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, mousemouse

Predictions only

Length 1,132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp43Q8BUM9 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms