Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP56

Pgghg, Protein-glucosylgalactosylhydroxylysine glucosidase, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PgghgQ8BP56 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PgghgQ8BP56 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PgghgQ8BP56 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PgghgQ8BP56 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
PgghgQ8BP56 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PgghgQ8BP56 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PgghgQ8BP56 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PgghgQ8BP56 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PgghgQ8BP56 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PgghgQ8BP56 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PgghgQ8BP56 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PgghgQ8BP56 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PgghgQ8BP56 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PgghgQ8BP56 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PgghgQ8BP56 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PgghgQ8BP56 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PgghgQ8BP56 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PgghgQ8BP56 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PgghgQ8BP56 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PgghgQ8BP56 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PgghgQ8BP56 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PgghgQ8BP56 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PgghgQ8BP56 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PgghgQ8BP56 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PgghgQ8BP56 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PgghgQ8BP56 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PgghgQ8BP56 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PgghgQ8BP56 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PgghgQ8BP56 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PgghgQ8BP56 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PgghgQ8BP56 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PgghgQ8BP56 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PgghgQ8BP56 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PgghgQ8BP56 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PgghgQ8BP56 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PgghgQ8BP56 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PgghgQ8BP56 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PgghgQ8BP56 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PgghgQ8BP56 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PgghgQ8BP56 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PgghgQ8BP56 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PgghgQ8BP56 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PgghgQ8BP56 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PgghgQ8BP56 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PgghgQ8BP56 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PgghgQ8BP56 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PgghgQ8BP56 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PgghgQ8BP56 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PgghgQ8BP56 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PgghgQ8BP56 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PgghgQ8BP56 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PgghgQ8BP56 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PgghgQ8BP56 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PgghgQ8BP56 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PgghgQ8BP56 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PgghgQ8BP56 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PgghgQ8BP56 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PgghgQ8BP56 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PgghgQ8BP56 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PgghgQ8BP56 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PgghgQ8BP56 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PgghgQ8BP56 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PgghgQ8BP56 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PgghgQ8BP56 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PgghgQ8BP56 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PgghgQ8BP56 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PgghgQ8BP56 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PgghgQ8BP56 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PgghgQ8BP56 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PgghgQ8BP56 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PgghgQ8BP56 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PgghgQ8BP56 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PgghgQ8BP56 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PgghgQ8BP56 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PgghgQ8BP56 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PgghgQ8BP56 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PgghgQ8BP56 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PgghgQ8BP56 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PgghgQ8BP56 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PgghgQ8BP56 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PgghgQ8BP56 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PgghgQ8BP56 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PgghgQ8BP56 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PgghgQ8BP56 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PgghgQ8BP56 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PgghgQ8BP56 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PgghgQ8BP56 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PgghgQ8BP56 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PgghgQ8BP56 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PgghgQ8BP56 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PgghgQ8BP56 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PgghgQ8BP56 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PgghgQ8BP56 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PgghgQ8BP56 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PgghgQ8BP56 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PgghgQ8BP56 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PgghgQ8BP56 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PgghgQ8BP56 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PgghgQ8BP56 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PgghgQ8BP56 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms