Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdca8Q8BHX3 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71 ms