Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cyp4f39Q8BGU0 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp4f39Q8BGU0 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms