Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE7

Trim6, Tripartite motif-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim6Q8BGE7 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim6Q8BGE7 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim6Q8BGE7 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim6Q8BGE7 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim6Q8BGE7 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim6Q8BGE7 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim6Q8BGE7 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim6Q8BGE7 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim6Q8BGE7 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim6Q8BGE7 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim6Q8BGE7 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim6Q8BGE7 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim6Q8BGE7 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim6Q8BGE7 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim6Q8BGE7 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim6Q8BGE7 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim6Q8BGE7 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim6Q8BGE7 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim6Q8BGE7 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim6Q8BGE7 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim6Q8BGE7 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim6Q8BGE7 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim6Q8BGE7 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim6Q8BGE7 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim6Q8BGE7 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim6Q8BGE7 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim6Q8BGE7 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim6Q8BGE7 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim6Q8BGE7 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim6Q8BGE7 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim6Q8BGE7 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim6Q8BGE7 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim6Q8BGE7 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim6Q8BGE7 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim6Q8BGE7 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim6Q8BGE7 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim6Q8BGE7 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim6Q8BGE7 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim6Q8BGE7 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim6Q8BGE7 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim6Q8BGE7 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim6Q8BGE7 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim6Q8BGE7 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim6Q8BGE7 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim6Q8BGE7 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim6Q8BGE7 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim6Q8BGE7 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim6Q8BGE7 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Trim6Q8BGE7 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim6Q8BGE7 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim6Q8BGE7 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim6Q8BGE7 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim6Q8BGE7 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim6Q8BGE7 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim6Q8BGE7 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim6Q8BGE7 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim6Q8BGE7 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim6Q8BGE7 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim6Q8BGE7 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim6Q8BGE7 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim6Q8BGE7 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim6Q8BGE7 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim6Q8BGE7 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim6Q8BGE7 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim6Q8BGE7 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim6Q8BGE7 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim6Q8BGE7 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim6Q8BGE7 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim6Q8BGE7 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim6Q8BGE7 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim6Q8BGE7 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim6Q8BGE7 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim6Q8BGE7 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim6Q8BGE7 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim6Q8BGE7 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim6Q8BGE7 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim6Q8BGE7 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim6Q8BGE7 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim6Q8BGE7 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim6Q8BGE7 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim6Q8BGE7 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim6Q8BGE7 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim6Q8BGE7 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim6Q8BGE7 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim6Q8BGE7 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim6Q8BGE7 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim6Q8BGE7 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim6Q8BGE7 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim6Q8BGE7 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim6Q8BGE7 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim6Q8BGE7 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim6Q8BGE7 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim6Q8BGE7 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim6Q8BGE7 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim6Q8BGE7 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim6Q8BGE7 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim6Q8BGE7 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim6Q8BGE7 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim6Q8BGE7 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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