Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFX1

Rnf187, E3 ubiquitin-protein ligase RNF187, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf187Q8BFX1 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf187Q8BFX1 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf187Q8BFX1 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf187Q8BFX1 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf187Q8BFX1 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf187Q8BFX1 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf187Q8BFX1 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf187Q8BFX1 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf187Q8BFX1 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf187Q8BFX1 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnf187Q8BFX1 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnf187Q8BFX1 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnf187Q8BFX1 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnf187Q8BFX1 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnf187Q8BFX1 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf187Q8BFX1 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Rnf187Q8BFX1 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
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Rnf187Q8BFX1 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf187Q8BFX1 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf187Q8BFX1 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf187Q8BFX1 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf187Q8BFX1 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf187Q8BFX1 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf187Q8BFX1 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf187Q8BFX1 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf187Q8BFX1 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf187Q8BFX1 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf187Q8BFX1 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf187Q8BFX1 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf187Q8BFX1 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf187Q8BFX1 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf187Q8BFX1 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf187Q8BFX1 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf187Q8BFX1 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf187Q8BFX1 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Rnf187Q8BFX1 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf187Q8BFX1 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf187Q8BFX1 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf187Q8BFX1 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf187Q8BFX1 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf187Q8BFX1 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf187Q8BFX1 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf187Q8BFX1 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf187Q8BFX1 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf187Q8BFX1 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf187Q8BFX1 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf187Q8BFX1 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf187Q8BFX1 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf187Q8BFX1 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf187Q8BFX1 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf187Q8BFX1 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Rnf187Q8BFX1 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf187Q8BFX1 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf187Q8BFX1 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf187Q8BFX1 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Rnf187Q8BFX1 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf187Q8BFX1 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf187Q8BFX1 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Rnf187Q8BFX1 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf187Q8BFX1 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf187Q8BFX1 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Rnf187Q8BFX1 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf187Q8BFX1 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf187Q8BFX1 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf187Q8BFX1 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf187Q8BFX1 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
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Rnf187Q8BFX1 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf187Q8BFX1 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf187Q8BFX1 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf187Q8BFX1 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf187Q8BFX1 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf187Q8BFX1 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf187Q8BFX1 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf187Q8BFX1 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf187Q8BFX1 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf187Q8BFX1 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf187Q8BFX1 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf187Q8BFX1 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf187Q8BFX1 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf187Q8BFX1 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf187Q8BFX1 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf187Q8BFX1 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Rnf187Q8BFX1 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Rnf187Q8BFX1 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
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