Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFU8

Slc17a8, Vesicular glutamate transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc17a8Q8BFU8 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc17a8Q8BFU8 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc17a8Q8BFU8 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc17a8Q8BFU8 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc17a8Q8BFU8 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc17a8Q8BFU8 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc17a8Q8BFU8 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc17a8Q8BFU8 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc17a8Q8BFU8 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc17a8Q8BFU8 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc17a8Q8BFU8 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc17a8Q8BFU8 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc17a8Q8BFU8 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc17a8Q8BFU8 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc17a8Q8BFU8 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc17a8Q8BFU8 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc17a8Q8BFU8 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc17a8Q8BFU8 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc17a8Q8BFU8 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc17a8Q8BFU8 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc17a8Q8BFU8 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc17a8Q8BFU8 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc17a8Q8BFU8 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc17a8Q8BFU8 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc17a8Q8BFU8 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc17a8Q8BFU8 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc17a8Q8BFU8 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc17a8Q8BFU8 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc17a8Q8BFU8 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc17a8Q8BFU8 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc17a8Q8BFU8 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc17a8Q8BFU8 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc17a8Q8BFU8 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc17a8Q8BFU8 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc17a8Q8BFU8 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc17a8Q8BFU8 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc17a8Q8BFU8 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc17a8Q8BFU8 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc17a8Q8BFU8 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc17a8Q8BFU8 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc17a8Q8BFU8 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc17a8Q8BFU8 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc17a8Q8BFU8 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc17a8Q8BFU8 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc17a8Q8BFU8 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc17a8Q8BFU8 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc17a8Q8BFU8 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc17a8Q8BFU8 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc17a8Q8BFU8 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc17a8Q8BFU8 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc17a8Q8BFU8 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc17a8Q8BFU8 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc17a8Q8BFU8 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc17a8Q8BFU8 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc17a8Q8BFU8 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc17a8Q8BFU8 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc17a8Q8BFU8 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc17a8Q8BFU8 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc17a8Q8BFU8 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc17a8Q8BFU8 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc17a8Q8BFU8 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc17a8Q8BFU8 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc17a8Q8BFU8 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc17a8Q8BFU8 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc17a8Q8BFU8 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc17a8Q8BFU8 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc17a8Q8BFU8 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc17a8Q8BFU8 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc17a8Q8BFU8 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc17a8Q8BFU8 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc17a8Q8BFU8 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc17a8Q8BFU8 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc17a8Q8BFU8 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc17a8Q8BFU8 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc17a8Q8BFU8 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc17a8Q8BFU8 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc17a8Q8BFU8 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc17a8Q8BFU8 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc17a8Q8BFU8 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc17a8Q8BFU8 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc17a8Q8BFU8 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc17a8Q8BFU8 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc17a8Q8BFU8 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc17a8Q8BFU8 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms