Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms