Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NfascQ810U3 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NfascQ810U3 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NfascQ810U3 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NfascQ810U3 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NfascQ810U3 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NfascQ810U3 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NfascQ810U3 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NfascQ810U3 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NfascQ810U3 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NfascQ810U3 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NfascQ810U3 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NfascQ810U3 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NfascQ810U3 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NfascQ810U3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NfascQ810U3 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NfascQ810U3 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NfascQ810U3 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NfascQ810U3 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NfascQ810U3 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NfascQ810U3 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NfascQ810U3 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NfascQ810U3 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NfascQ810U3 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NfascQ810U3 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NfascQ810U3 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NfascQ810U3 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NfascQ810U3 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NfascQ810U3 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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NfascQ810U3 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NfascQ810U3 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NfascQ810U3 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NfascQ810U3 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NfascQ810U3 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NfascQ810U3 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NfascQ810U3 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NfascQ810U3 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NfascQ810U3 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NfascQ810U3 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NfascQ810U3 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NfascQ810U3 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NfascQ810U3 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NfascQ810U3 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NfascQ810U3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NfascQ810U3 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NfascQ810U3 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NfascQ810U3 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NfascQ810U3 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NfascQ810U3 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NfascQ810U3 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NfascQ810U3 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NfascQ810U3 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NfascQ810U3 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NfascQ810U3 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NfascQ810U3 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NfascQ810U3 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NfascQ810U3 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NfascQ810U3 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NfascQ810U3 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NfascQ810U3 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NfascQ810U3 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NfascQ810U3 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NfascQ810U3 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NfascQ810U3 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NfascQ810U3 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
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NfascQ810U3 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NfascQ810U3 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NfascQ810U3 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NfascQ810U3 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NfascQ810U3 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NfascQ810U3 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NfascQ810U3 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NfascQ810U3 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NfascQ810U3 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NfascQ810U3 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NfascQ810U3 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NfascQ810U3 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NfascQ810U3 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NfascQ810U3 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NfascQ810U3 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NfascQ810U3 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NfascQ810U3 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NfascQ810U3 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NfascQ810U3 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NfascQ810U3 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NfascQ810U3 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NfascQ810U3 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NfascQ810U3 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NfascQ810U3 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NfascQ810U3 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NfascQ810U3 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NfascQ810U3 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NfascQ810U3 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NfascQ810U3 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NfascQ810U3 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NfascQ810U3 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NfascQ810U3 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
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