Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms